1990年9月，蓝靛厂北门外10号租期届满，必须搬迁。

法华寺甲5号，是附中的新校址，搬到这里，站稳脚跟，是唯一的选择。

于是，在这里建起两排砖木结构平房，再搭起几排铁架支撑、油毡盖顶、薄板当墙的板房。砖房作学生宿舍和教室，板房作办公室、食堂、图书馆、仪器室。

1990年8月7日起，附中教职工再次有课上课，无课搬迁；白天上课，晚上搬迁。自己动手，打包、装车、卸车、安放。9月30日，学校搬到了法华寺甲5号。10月3日，在新址上起了第一节课。

从80年代末到90年代初，是建国后附中最困难最艰苦的时期。三年之内，两次搬迁。一所运转了74年的老校，桌椅板凳，锅碗瓢盆，床板床架，实验设备，办公用品，体育器材，应有尽有。打包，装车，押车，卸车，摆放，工程浩大，艰苦异常。若非亲自经历，实在难以想象！堪称奇迹的是，两次搬迁，都没有请搬迁公司，所有工作都是在不影响教学的前提下，由教职工在没有加班费的情况下加班加点完成的。他们为了附中的生存和发展，作出了艰苦的付出，巨大的牺牲，作出了不可磨灭的贡献！

当时，有人说：现在民族地区都有了中小学，还有必要在北京办这么一所附中吗？他们不了解附中的历史，不知道她曾经是内蒙古革命的摇篮，是乌兰夫为代表的一代民族英豪的启蒙宝地，是毛泽东和党中央十分关注的学校。也不知道她先后受中央指示开办云南班、新疆班、医预班、西藏班，为繁荣边疆、稳定边疆，为边疆的反分裂、反颠覆、反渗透斗争发挥着重要作用。更不懂得附中在全国民族中学中具有示范作用，是体现党的民族政策、反映党对少数民族关怀的重要窗口之一。如果附中毁在我们手里，我们岂不成了历史罪人？个人的命运可以改变，但附中的办学性质不应改变；教师的物质利益可以牺牲，但附中不能牺牲。困难是暂时的，前程是光明的。这是附中从领导到教职工坚定不移的信念。我们和民族教育难以割舍，和附中的命运难以割舍，和各民族学子的感情难以割舍。

正是有基于此，在校舍简陋——在临时搭建的平房里，在各种教学设施都不完备的情况下，在物质待遇已受影响的时候，附中教师依然坚持敬业精神，认真教好学生；学生也勤奋学习，较出色地学完学业。1991届高中毕业生成绩优秀，绝大部分都上了大学，有的已才能初显。这里就介绍马云。

马云，女，回族，宁夏固原人，1991届校友。西北第二民族学院毕业。宁夏军区某团政治处副主任，入伍以后，把本职岗位作为奉献军营的人生舞台，勤奋敬业，拼搏进取，坚持用知识带兵育兵，先后帮助100多名战士走上成材之路。曾荣立三等功2次，一等功1次，2002年获得全国民族知识竞赛团体第一名，2003年当选宁夏回族自治区第五届“十大杰出青年”之一。2004年获得国家民委授予的“第四届全国各民族青年团体进步杰出奖”，2005年被总政治部表彰为“全军优秀地方大学生干部”。

因为搬迁和校舍所限，附中1986、1987、1989、1990、1992、1993、1995年共7个年头没有招生。1988至1995年的8年内，附中在校学生只有一个年级，80多人。这种局面的直接后果是：一是少培养了人，二是很多教师无课可教，导致部分骨干教师流失，留在学校的也离开课堂，用非所长，使附中教师的优势有所减弱；三是全校只有一个年级的学生，就像一个独生子，有点孤零零，不利于成长。

所以说，这是建国后附中最困难的时期。在这时坚持附中办学，高举民族教育的旗帜，就是民族教育的幸事。谁坚守这块民族教育的阵地，谁就是民族教育事业的守望者。