蒙藏学校是由咸安宫学、唐古忒学、托忒学、蒙古学等四所官学的基础上合并而成。

1938年至1939年成书的《北京市志稿》引用有关记载说，咸安宫学在器皿库之西，东向，房二十七间。雍正六年(1728)特设，以教育内府三旗子弟及景山官学中之后秀者。派翰林等官督课。

乾隆十六年(1751)，改建寿安宫，官学移置西华门旧尚衣监。道光二十三年(1843)，核减月费、膏火(经费)。同治年间，编纂《方略》，借该官学学舍开馆编修志书，于是学生到学更加稀少。光绪八年，管理尚书志和、总裁少詹事宝昌，酌立章程，进行了一些整顿，官学稳定了些。

唐古忒学，就是藏学，是清王朝为培养藏语研究和翻译人才的官学，其创始年代不详。

托忒学，是蒙古学的一个分支，是培养新疆托忒蒙古语研究和翻译人才的官学，其创始年代亦不详。

蒙古学，《北京市志稿》引用有关记载说，蒙古官学，乾隆十二年(1747)设立。于八旗蒙古官学内，每旗拣选三名，共二十四名，令在学读蒙古经书及阿里嘎里子韵，并书写乌木克蒙古翻译等学业。官学中有满族教习(教师)二人，学生二十四人。

辛亥革命后，这四所官学年龄大的学生到社会就业，年龄小的学生仍滞留学校。但学校已不能正常开课，他们的出路要由蒙藏事务局帮助解决。

鉴于内蒙古、西藏、青海、新疆等地当时学校教育仍很滞后，蒙藏学校招生困难诸多。于是将上述四所官学合并组成蒙藏学校。